2009年，福建省食品药品监督管理局联合省经贸委、公安厅、卫生厅、工商局等部门联合开展药品安全专项整治行动，进一步整顿和规范全省药品市场秩序，确保群众用药安全。据不完全统计，2009年上半年，全省共出动稽查执法人员46132人次，查处各类药械违法案件1424件，开展药品监督性抽样3782批次，完成检验2387批次。
　　此次行动重点整治严重扰乱流通秩序的违法行为，强化对农村药品市场的监管，推进农村药品监督网和供应网建设，依法查处和取缔无证经营行为，严厉打击制售假劣药品违法违规行为，进一步规范农村药品市场秩序。全面开展药品经营企业监督检查，对药品经营企业的监督检查覆盖面必须达到100%。此外，福建省食品药品监督管理局还将严格药品经营企业市场准入管理，全面清理2008年以来新开办的药品批发企业，对达不到法定条件和要求的，责令停业整顿，收回《药品经营许可证》，整治虚假违法药品、医疗器械广告，建立违法广告的公告、市场退出、信用监管和责任追究制。
　　福建省食品药品监督管理局通过对重点产品、重点单位、重点区域的集中整治，建立健全贯穿药品、医疗器械研制、原料进厂、出厂销售的药品全过程监管链条，建立产品质量的追溯体系和责任追究体系，提高全省药品质量和安全水平。